1. Menggunakan jangkar (Sprig anchored)

Metode jangkar adalah metode yang dilakukan dengan cara mengambil bibit lamun tanpa sustrat, kemudian ditransplantasikan ke tempat yang baru. Bibit lamun dikaitkan ke jangkar dan ditimbun ke dasar substrat. Jangkar yang dapat digunakan diantaranya adalah staples, rods, ring, dan frames. Umumnya metode ini dilakukan pada wilayah perairan yang berarus, sehingga lamun yang ditransplantasi tidak terbawa arus.Tanpa jangkar

2. Tanpa jangkar

Metode tanpa jangkar adalah metode transplantasi yang dilakukan tanpa mengaitkan lamun dengan jangkar. Contoh transplantasi tanpa jangkar yaitu metode plugs dan pembibitan (seeds)

a. Plug merupakan metode transplantasi dengan memindahkan lamun lengkap dengan rizoma lengkap dengan sedimennya.

b. Pembibitan (Seeds) adalah metode yang dilakukan dengan memanfaatkan biji lamun, yang selanjutnya ditanam pada lokasi tertentu